Chamadas assíncronas com GNU Parallel

Uma maneira bem simples de aproveitar todo o potencial do seu processador é criar chamadas em paralelo utilizando o GNU Parallel.

1. Instalando Parallel
1. sudo apt-get install parallel
2. Criar uma lista de comando txt com os scripts à serem chamados por ex: (R, Pyhon) já com os argumentos à serem passados
3. Abrir o terminal de comando e digite o comando:
1. parallel -j 8 < lista.txt (-j significa o número de núcleos da máquina para serem utilizados).
4. Tecle Enter e sua lista de scripts serão chamados de acordo com a lista em paralelo.

Chamada de scripts R por linha de comando

Para executar uma chamada do script R por linha de comando basta executar como abaixo onde é chamado o script e passado alguns parâmetros:

Rscript --vanilla sillyScript.R iris.txt out.txt

Instalando pacotes R

Para efetuar a instalação de pacotes do R basta um comando simples, basta entrar dentro da plataforma R e digitar o comando abaixo:

install.packages('nome_do_pacote', dependencies=TRUE)

obs: No Ubuntu para instalar alguns pacotes é necessário instalar o OpenSSL para isso basta seguir os passos abaixo antes de instalar o pacote no R.

sudo apt-get -y build-dep libcurl4-gnutls-dev
sudo apt-get -y install libcurl4-gnutls-dev

Instalando R por linha de comando no Ubuntu

Para efetuar a instalação do R por linha de comando é necessário alguns passos simples:

1. Inserir a fonte na lista do Ubntu

sudo sh -c 'echo "deb http://cran.rstudio.com/bin/linux/ubuntu trusty/" >> /etc/apt/sources.list'

2. Criando uma chave para o registro

gpg --keyserver keyserver.ubuntu.com --recv-key E084DAB9

3. Adicionando a chave para o registro:

gpg -a --export E084DAB9 | sudo apt-key add -

4.Atualizando as fontes de dados:

sudo apt-get update

5.Instalando o R

sudo apt-get -y install r-base

Voilá! se tudo correu bem o R ja está instalado, para testar basta digitar na linha de comando a letra R, se o R se instalou corretamente a seguinte mensagem será apresentada:

Operações aritméticas com vetores em R

// Comment
#OPERAÇÕES COM VETORES
v1 <- 1:10="" 2="" de="" do="" multiplicando="" os="" por="" quadrada="" raiz="" sqrt="" todas="" um="" v1="" valores="" vetor="">= 3 #checando quais valores são maiores ou igual a 3

c(1,2,3,4) %in% v1 #verificando se determinados valores existem dentro de um vetor

c(1,2,3,4) * tail(v1,4) #pegando alguns elementos de um vetor e multiplicando dois vetores

c(1,2,3,4) * c(3,5) #multiplicando dois vetores

seq(from=10, to=100, by=0.5) #criando uma sequencia de números

vector(mode = "numeric", length = 2) #criando vetores em branco

vector(mode = "character", length = 10) #criando vetores de texto em branco

vector(mode = "logical", length = 3) #criando vetores de boleano em branco

rep(x = 22, times = 10) #criando vetor com valores repetidos
x = c(18, 0, 9)

rep(x, 3) #criando um vetor a partir da repetição de outro

v1[1:2] #recuperando elementos específicos de um array

v1[c(1,2,3)] 
v1[v1>1 & v1 < 4] #recuperando um intervalo de valores
v1[v1>4 | v1 < 10]

#Manipulando Vetores em R
a <- c(1:5)
b <- c(6,NA,7,NA,8,NA,9)
c <- c("1","2","5","6")

clean <- complete.cases(b) #filtra apenas os itens completos de uma array
is.na(b) #filtra apenas os objetos vazios de um array

b[clean] #filtrando os itens do array completos